河海大学和南京林业大学都是江苏省内重点大学，而且都涉及国家基本治理范围。河海大学是水利方面的佼佼者，而南京林业大学则是森林方面的实力派，两家高校在各自擅长的领域内实力都很强，但是相对来讲河海大学影响力更强一些。
河海大学真正名震四海，主要是两个阶段，第一阶段是60年代，这一时期国家大修水利设施。建国前27年，国家投入建设多所水利设施，这其中河海大学参与多项重点项目，使得河海大学很早就名气远播。第二阶段是年之后，这期间国内大型水利设施上马，基本都能看见河海大学的身影。只是近些年都是大工程，不像当年都在人民中发展，获得群众认同感相对较低一些。
南京林业大学也流淌着名校的血液，他的基础来自原南京林学院，后来又合并了武汉大学、南昌大学、湖北农学院的森林系，建校班底实力非常强。虽然南林是全国性重点大学，但是其影响范围相对较小，主要在华东地区。而国内森林资源应用型较强是在东北，所以对其很重视，但并没有拔高到最顶级。因此南京林业大学虽然实力很强，但其擅长方面的影响力，并没有河海大学高。
南京林业大学在林业工程、林学、园林学方面实力都非常强，林木新品种方面南林有其独到的地方。河海大学在水利、土木、环科方面实力突出，尤其水文水利工程方面有绝对的硬实力。虽然两所学校都在走综合性高校的路线，也开设了其他学科及专业，但是相对实力并不强，仅是其牌子值钱而已。毕竟现在招工更注重“双一流”这个头衔，哪怕是选调生，也更具有优势。
总体来看，河海大学的实力略高于南京林业大学。这主要是河海大学在其擅长领域内的影响力和知名度要高于南京林业大学，当然也要看到南京林业大学的规模要比河海大学稍大一些。